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MIRA結(jié)合試紙條快速檢測致病菌溶血葡萄球菌是一種革蘭氏陽性凝固酶陰性細(xì)菌,在醫(yī)院中非常常見。近年來由于醫(yī)院獲得性感染的風(fēng)險(xiǎn)較高,受到越來越多的關(guān)注。溶血葡萄球菌可進(jìn)一步導(dǎo)致皮膚感染、腦膜炎、腹膜炎,甚至敗血癥。臨床診斷的延遲會導(dǎo)致健康狀況的惡化,因此快速診斷溶血葡萄球菌是精確治療的關(guān)鍵。
中國連云港市第二人民醫(yī)院中央實(shí)驗(yàn)室科的季拓老師課題組,在《Analytica Chimica Acta》期刊上發(fā)表文章《A rapid and visual detection of Staphylococcus haemolyticus in clinical specimens with MIRA-LFS》,影響因子6.2。 1.研究概述 在該研究中,建立了一種基于mvaA基因的MIRA-LFS檢測溶血葡萄球菌的方法,使用多酶恒溫快速核酸擴(kuò)增技術(shù)MIRA與側(cè)流試紙條LFS結(jié)合,實(shí)現(xiàn)快速病原體檢測。 實(shí)驗(yàn)在37℃下進(jìn)行,可在9min內(nèi)檢測到結(jié)果,檢測靈敏度為0.147CFU/反應(yīng)。 MIRA-LFS檢測方法適用于臨床樣本中溶血葡萄球菌的定點(diǎn)檢測,實(shí)現(xiàn)了POCT鑒別溶血葡萄球菌的方法,對醫(yī)療服務(wù)不足地區(qū)的快速疾病診斷和治療具有重要價(jià)值。 課題組用MIRA-LFS、qPCR和傳統(tǒng)細(xì)菌培養(yǎng)方法對95個隨機(jī)臨床樣本進(jìn)行分析,證實(shí)了臨床適用性。 2.研究方法
MIRA-LFS檢測示意圖如上所示。 研究使用了安普未來生物的DNA恒溫快速擴(kuò)增試劑盒(膠體金試紙條型)、核酸檢測試紙條。
mvaA基因引物長度為30-35個核苷酸,擴(kuò)增產(chǎn)物長度為100-350bp,共設(shè)計(jì)6對候選引物。利用標(biāo)準(zhǔn)溶血葡萄球菌菌株的gDNA進(jìn)行MIRA分析,篩選候選引物,用2%瓊脂糖凝膠電泳顯示擴(kuò)增產(chǎn)物。 (使用瓊脂糖凝膠電泳顯示擴(kuò)增產(chǎn)物) 再根據(jù)正向引物序列(向后延伸16bp)設(shè)計(jì)探針。探針的5’端用FITC標(biāo)記,3’端標(biāo)記C3阻斷。利用THF替換探針中31位的核苷酸,THF距離5’端30bp,距離3’端15bp。所選的反向引物的5’端用生物素進(jìn)行標(biāo)記。 (引物探針組合的交叉二聚體和序列修飾示意圖) 并且,課題組優(yōu)化了溶血葡萄球菌MIRA-LFS檢測的反應(yīng)條件。在37℃下,從4-12min每間隔2min進(jìn)行測試。結(jié)果顯示在8min反應(yīng)時(shí)間,試驗(yàn)線清晰可見。另外,從22-52℃,每間隔5℃進(jìn)行測試。37-42℃是最適合MIRA-LFS檢測的溫度。因此,溶血葡萄球菌MIRA-LFS法的最佳反應(yīng)時(shí)間和溫度,分別為8min和37℃。加上最終結(jié)果在1min內(nèi)通過LFS可視化,總檢測時(shí)間為9min。 (反應(yīng)時(shí)間、溫度的優(yōu)化) 3.實(shí)驗(yàn)結(jié)果 1. 靈敏度驗(yàn)證 從連續(xù)稀釋的溶血葡萄球菌培養(yǎng)物(10^6-10^0CFU/mL)中獲得的不同濃度的基因組DNA(gDNA)進(jìn)行MIRA-LFS檢測。 (不同濃度下的陽性信號) 通過概率單位回歸分析顯示,MIRA-LFS檢測法測定的95% LOD為0.147CFU/反應(yīng)。
(檢測限計(jì)算) 2. 特異性驗(yàn)證 通過分析18株常見的致病微生物菌株和15株臨床溶血葡萄球菌菌株,測定了溶血葡萄球菌MIRA-LFS檢測的選擇性。結(jié)果顯示,MIRA-LFS檢測對其他18種致病菌均為陰性,對15個已驗(yàn)證的溶血葡萄球菌臨床樣本均呈陽性。 (分別檢測8株標(biāo)準(zhǔn)致病菌菌株、15株臨床溶血性鏈球菌菌株) MIRA-LFS檢測具有高選擇性,適合溶血葡萄球菌的篩選。 3.實(shí)際樣本檢測 連云港第二人民醫(yī)院隨機(jī)采集的95份標(biāo)本,包含皮膚軟組織35份、尿液16份、痰14份和血液30份樣本。 (不同方法檢測95例臨床標(biāo)本) 結(jié)果表明,該檢測方法與qPCR法符合度達(dá)100%。此外,與金標(biāo)準(zhǔn)(GB/T4789.11-2003)相比,MIRA-LFS檢測方法鑒定溶血葡萄球菌感染的靈敏度和特異性分別為100%和98.73%。這些結(jié)果進(jìn)一步驗(yàn)證了該方法在檢測臨床樣本中溶血葡萄球菌的技術(shù)可行性。
MIRA-LFS方法用于快速POCT檢測溶血葡萄球菌,具備高效、準(zhǔn)確、簡單、經(jīng)濟(jì)成本低的特性,有助于快速做出診斷和治療決策。
了解MIRA技術(shù) 安普未來多酶恒溫快速核酸擴(kuò)增技術(shù)MIRA技術(shù)在恒溫39°C-42°C下核酸擴(kuò)增,反應(yīng)時(shí)間僅為5-20 min。此外,不需要嚴(yán)格的實(shí)驗(yàn)室條件,應(yīng)用場景多元化:綜合醫(yī)院檢驗(yàn)科、基層醫(yī)療、居家檢測、田間地頭等。 試劑產(chǎn)品形態(tài)多樣化:凍干粉、凍干微球等;顯示結(jié)果的多樣性:凝膠電泳、熒光曲線、膠體金試紙條等。試劑性能穩(wěn)定、便于操作、方便存儲運(yùn)輸。 并以MIRA為核心平臺技術(shù)研發(fā)出“超快速核酸釋放技術(shù)”、“雙通道恒溫?zé)晒鈾z測儀”、“一體化全自動封閉檢測系統(tǒng)”、“自測型核酸檢測裝置”等一系列配套產(chǎn)品,打造快速分子檢測整體解決方案。 |